Agaróz géleket használnak DNS-sel, a biomolekulák nagyobb mérete miatt (a DNS-fragmensek gyakran több ezer kDa-osak). A fehérje géleknél a poliakrilamid jó felbontást ad, mivel a sokkal kisebb méret (jellemzően 50 kDa) jobban megfelel a gél szűkebb intermolekuláris réseinek.
Mi a különbség az agaróz gélelektroforézis és a poliakrilamid gélelektroforézis között?
A fő különbség az agaróz és a poliakrilamid között, hogy agarózt használnak az agaróz gélelektroforézisben (AGE) főként a DNS elválasztására, míg a poliakrilamidot a poliakrilamid gélben használják elektroforézis (PAGE) elsősorban fehérjék elválasztására.
Miért jobbak a poliakrilamid gélek, mint az agaróz gél?
A poliakrilamid géleknek a következő három fő előnyük van az agaróz gélekkel szemben: (1) Felbontóképességük olyan nagy, hogy el tudják különíteni azokat a DNS-molekulákat, amelyek hossza mindössze 0,1%-kal (azaz 1 bp az 1000 bp-ban)). (2) Sokkal nagyobb mennyiségű DNS-t tudnak befogadni, mint az agaróz gélek.
Miért használnak poliakrilamidot agaróz helyett a fehérjék jellemzésére?
A poliakrilamid és az agaróz az elektroforézisben általánosan használt két hordozómátrix. … Az agaróz nagy pórusméretű, és alkalmas nukleinsavak és nagy fehérjekomplexek szétválasztására. A poliakrilamid kisebb pórusmérettel rendelkezik, és ideáliselválasztja a fehérjék többségét és a kisebb nukleinsavakat.
Miért használnak poliakrilamid gélt?
A poliakrilamid gélelektroforézist (PAGE) rutinszerűen használják fehérjeanalízishez, és 100 bp-nál kisebb nukleinsavfragmensek elkülönítésére is használható. A nukleinsavakat általában folyamatos pufferrendszerrel analizálják, ahol a puffer összetétele, pH-ja és pórusmérete állandó a gélben.