A molekuláris biológiában a STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) az ismert és előre jelzett fehérje-fehérje kölcsönhatások biológiai adatbázisa és webes forrása. … A legújabb, 11b verzió több mint 5000 élőlény mintegy 24,5 millió fehérjéről tartalmaz információkat.
Mi a STRING adatbázis célja?
A STRING adatbázis célja, hogy összegyűjtse és integrálja ezeket az információkat az ismert és előre jelzett fehérje-asszociációs adatok konszolidálásával –nagyszámú szervezetre vonatkozó fehérjetársulási adatok.
Mi az a STRING pontszám?
A STRING programban minden fehérje-fehérje kölcsönhatás egy vagy több „pontszámmal” van ellátva. Fontos, hogy ezek a pontszámok nem jelzik az interakció erősségét vagy specifikusságát. Ehelyett a bizalom mutatói, azaz mennyire valószínű, hogy STRING igaznak ítél egy interakciót a rendelkezésre álló bizonyítékok alapján.
Miért hatnak egymásra a fehérjék?
A fehérje-fehérje kölcsönhatások (PPI-k) nagy specifitású fizikai érintkezések, amelyek két vagy több fehérjemolekula között létrejöttek olyan biokémiai események eredményeként, amelyeket elektrosztatikus erőket és hidrogént tartalmazó kölcsönhatások irányítanak. kötés és a hidrofób hatás.
Mi a funkcionális társítás?
definíció. Bináris kapcsolat a biológiai entitások között amikor az egyik modulálja a másikat a másik funkciója, kifejezése, leépülése vagy stabilitása és a kapcsolat szempontjábólA partnerek közötti kapcsolat nem állapítható meg közvetlenként, ezért köztes lépések implicit módon jelen vannak.
