A prolin gyakran megtalálható az α spirál végén vagy fordulatokban vagy hurkokban. Más aminosavaktól eltérően, amelyek szinte kizárólag transzformált formában fordulnak elő a polipeptidekben, a prolin cisz-konfigurációban is előfordulhat a peptidekben.
Tartalmaznak az alfa-hélixek prolinmaradékot?
Most, hogy több mint 30 000 fehérjeszerkezet található a Protein Data Bankban, világos, hogy prolinmaradékok vannak jelen az α-hélixekben, ahol gyakran fontos szerepet játszanak a fehérje szerkezetében és működésében.
Milyen aminosavak vannak az alfa-hélixekben?
A 20 aminosav közül bármelyik részt vehet az α-hélixben, de egyesek előnyösebbek, mint mások. Ala, Glu, Leu és Met leggyakrabban a hélixekben találhatók, míg a Gly, Tyr, Ser és Pro ritkábban látható.
Tartalmaznak a béta lapok prolint?
A Proline-t nem részesítik előnyben a béta lapszerkezetekben, mivel nem tudja befejezni a H-kötési hálózatot. Ha a prolin előfordul a lemezekben, akkor előfordulhat, hogy egy dudorban vagy lapszélben van, ahol az amino-hidrogénkötés-doner hiánya nem kritikus.
Mi tartalmaz alfa hélixeket?
Az alfa-hélix (α-hélix) gyakori motívum a fehérjék másodlagos szerkezetében, és egy jobb kéz-hélix konformáció, amelyben minden gerinc N-H hidrogénatomot tartalmaz. kötődik a gerinchez C=O. az aminosavak csoportja, amely négy csoporttal korábban található a fehérjeszekvencia mentén.
